Síran měďnatý se používá při prevenci nemoci kopyt u skotu. Díky své vysoké toxicitě a fungicidním vlastnostem je síran měďnatý běžně používán ve formě vodného roztoku při procesu ošetřování dřeva.

Síran měďnatý je nepostradatelnou složkou při chemickém procesu nanášení mědi. Používá se v procesu elektrolytického pokovování mědí v tzv. kyselých lázních a pro elektrolytickou výrobu měděných anod. Vzhledem k vysoké toxicitě síranu měďnatého pro vodní organismy je nutné dbát o bezpečnost při přepravě a použití by nemělo vést k nekontrolovanému uvolnění do přírody. Síran měďnatý není biologicky odbouratelný.